Эти новаторские открытия основаны на генетическом секвенировании опухолевых клеток 62-летнего пациента с агрессивным высококлеточным вариантом папиллярного рака щитовидной железы, согласно исследованию, опубликованному 18 марта в World Journal of Surgery, официальном журнале Международное общество хирургии.
Рак щитовидной железы у пациента рецидивировал после того, как он перенес несколько операций, дистанционное облучение и химиотерапию, и поэтому пациент оказался кандидатом на дополнительное исследование.
После одной операции в июне 2011 года был получен образец опухоли пациента и изучен с помощью полногеномного секвенирования, в котором TGen описывает, по порядку, более 3 миллиардов пар химических оснований, составляющих ДНК человека.
Сравнение опухолевой ДНК с нормальной ДНК пациента обнаружило 57 мутаций в 55 генах ракового генома. Исследователи также обнаружили перестройку между двумя генами. Эта транслокация и слияние EML4-ALK были идентифицированы как генетический драйвер рака пациента.
«Это первый отчет о секвенировании всего генома папиллярного рака щитовидной железы, в котором мы идентифицировали транслокацию EML4-ALK. Это важно, потому что у нас есть лекарство, которое может воздействовать на это слияние и лечить пациента », — сказал д-р.
Майкл Дж. Демер, клинический профессор и директор отделения редких онкологических заболеваний TGen, а также главный исследователь и ведущий автор исследования. "Опухоль этого пациента не содержит более известных генных мутаций, которые связаны с большинством видов рака щитовидной железы. Эти данные свидетельствуют о том, что эта опухоль имеет отчетливый онкогенез или генетическую причину рака."
Существует несколько вариантов лечения пациентов с агрессивным папиллярным раком щитовидной железы, устойчивым к радиоактивному йоду. Слияние EML4-ALK появляется примерно в 5% случаев рака легких, которые обычно лечатся целевым препаратом, известным как кризотиниб.
Выявив слияние EML4-ALK в этом исследовании, TGen смог порекомендовать кризотиниб 62-летнему пациенту в этом исследовании, у которого рак оставался без прогрессирования в течение более 6 месяцев.
«Технологии секвенирования всего генома обещают обеспечить точное целевое лечение заболеваний человека, включая рак», — сказал д-р. Джон Карптен, заместитель директора TGen по фундаментальной науке и директор отдела комплексной геномики рака TGen, и старший автор исследования. "Благодаря более глубокому пониманию молекулярного онкогенеза конкретного рака можно надеяться разработать более эффективные индивидуальные методы лечения."
Согласно исследованию, полногеномное секвенирование особенно полезно для пациентов с относительно редкими опухолями, поскольку они, как правило, имеют меньший доступ к новым лекарственным препаратам, часто доступным в ходе клинических испытаний.