Гены, борющиеся с вирусами, связаны с мутациями при раке: генетические данные подтверждают роль семейства генов в развитии рака

Исследователи обнаружили важное генетическое свидетельство, подтверждающее роль группы генов, борющихся с вирусами, в развитии рака.
Наше понимание биологических процессов, вызывающих рак, ограничено.

Ультрафиолет и курение — два хорошо изученных процесса, вызывающих рак. Воздействие любого из этих процессов вызывает различимые закономерности генетического повреждения или « сигнатуры » генома, которые могут привести к раку. Все процессы, вызывающие рак, оставляют свой собственный отпечаток или подпись в геномах раковых клеток.

Семейство генов APOBEC контролирует ферменты, которые, как полагают, эволюционировали у людей для борьбы с вирусными инфекциями. Ученые предположили, что эти ферменты ответственны за очень четкую сигнатуру мутаций, которая присутствует примерно в половине всех типов рака.

Следовательно, понимание вызывающего рак процесса, лежащего в основе этой общей генетической сигнатуры, имеет решающее значение для контроля и профилактики заболеваний.
Команда изучила геномы рака груди у пациентов со специфической наследственной делецией в двух из этих генов APOBEC.

Они обнаружили, что в геномах этих раковых опухолей гораздо больше преобладают отчетливые мутационные сигнатуры, которые, как считается, обусловлены семейством генов APOBEC.
«Повышенная частота этой общей сигнатуры рака у пациентов с раком груди с аномалиями гена APOBEC подтверждает нашу теорию о том, что эти ферменты играют роль в генерации этой мутационной сигнатуры», — говорит д-р Серена Ник-Зайнал, первый автор из Wellcome Trust Sanger Institute.

Эта генетическая делеция обнаружена на хромосоме 22, где гены APOBEC, APOBEC3A и APOBEC3B, расположены рядом друг с другом. Ранее сообщалось, что женщины с этой генетической делецией более восприимчивы к раку груди.
Команда исследовала 923 образца рака груди у женщин со всего мира и обнаружила более 140 человек с одной или двумя копиями делеции на каждой хромосоме. Рак груди у женщин с делецией имел гораздо большее количество мутаций именно этой генетической сигнатуры.

Однако мутационная активность генов APOBEC кажется палкой о двух концах. Эта генетическая делеция гораздо более распространена в одних популяциях, чем в других: она встречается только у 8 процентов европейцев, но присутствует у 93 процентов населения Океании.

Хотя эта делеция увеличивает риск развития рака, она также дает неизвестное в настоящее время преимущество в популяциях, где она более распространена.
«В дополнение к этому процессу, опосредованному APOBEC, существует гораздо больше мутационных процессов, вызывающих рак, глубинная природа которых еще не выяснена», — говорит профессор сэр Майк Стрэттон, ведущий автор и директор Института Сэнгера. "Выяснение того, что представляют собой эти мутационные процессы, в будущем окажет огромное влияние на то, как мы предотвращаем и лечим рак."