Такое отсутствие микробного представительства оставляет неизведанным мир неиспользованного генетического потенциала, согласно исчерпывающему опросу, проведенному исследователями текущих геномных проектов UBC. Результаты опроса опубликованы в майском номере журнала Trends in Ecology and Evolution.
«Мы по-прежнему в основном анализируем одни и те же хорошо известные группы эукариот: животные, грибы и растения, во многом потому, что их полезность более очевидна, они ближе к нам, как людям, и, откровенно говоря, потому, что мы можем видеть их невооруженным глазом. ", — говорит Хавьер дель Кампо, ведущий автор статьи и эксперт по микробной экологии простейших, сложных одноклеточных организмов.
"Но с точки зрения биологического разнообразия и генома этот антропоцентрический подход неуместен и потенциально сдерживает нас.
Мы упускаем возможность изучить большую часть эукариотического разнообразия планеты, что означает, что мы упускаем возможность изучить множество альтернативных жизненных стратегий, новых метаболических путей, новых функций генов."
Авторы призывают к более широкой, объективной и основанной на видовых взаимоотношениях инициативе по секвенированию микробных эукариотических геномов, чтобы охватить всю широту их разнообразия.
Фон
Исследователи проанализировали все проекты по исследованию генома, действующие или планируемые к запуску, и обнаружили, что 51% известных эукариотических линий еще не представлены и не изучены на геномном уровне.
Геномные базы данных сильно предвзято относятся к сложным одноклеточным организмам, особенно к линиям Rhizaria, Amoebozoa и гетеротрофным линиям Stramenopiles.
Исследование также проанализировало пять крупнейших коллекций эукариотических культур и определило, что до 25% описанных эукариотических линий не имеют представителей в культуре.