Молекулы, пересекающие такие биологические каналы, часто состоят из цепочки атомов, которая может быть больше диаметра поры, обычно меньше 2 нанометров в ширину и 10 нанометров в длину. Это означает, что движущая сила необходима для преодоления энергетического барьера канала, ограничивающего цепь до нанопоры. Уровень этого энергетического барьера также зависит от взаимодействий молекула-пора.
Ранее авторы исследовали другую нанопору, называемую альфа-гемолизином.Чтобы изучить динамику в замкнутой среде на уровне отдельных молекул, ученые полагаются на электрическое обнаружение.
Они определили влияние частично свернутых белковых цепей при пересечении канала, что приводит к очень долгой блокаде в нанопорах. Основываясь на сравнении с их предыдущей работой над нанопорами альфа-гемолизина, они доказали, что переход к разворачиванию белка не зависит от используемой нанопоры.
Для полностью развернутого белка авторы продемонстрировали, что вход в поры должен преодолевать минимальный энергетический барьер. Они также показали, что время транспортировки экспоненциально уменьшается с приложенным напряжением и увеличивается с увеличением длины белковой цепи.