Исследователи с помощью вычислений находят иголку в стоге сена для лечения редких заболеваний.

«Редкие болезни иногда поражают настолько малочисленное население, что поиск методов лечения будет невозможен с финансовой точки зрения, если только не будут приняты гуманитарные и правительственные стимулы. Эти состояния, которые иногда остаются невылеченными, называются« сиротскими болезнями ». Мы разработали способ компьютерного нахождения совпадений между структурами и функциями белков редких заболеваний и существующими лекарственными взаимодействиями, которые могут помочь в лечении пациентов с некоторыми из этих орфанных заболеваний », — сказал Мисаг Надери, один из ведущих авторов статьи и докторант кафедры ЛГУ. биологических наук.Это исследование будет опубликовано на этой неделе в журнале npj Systems Biology and Applications, публикуемом издательством Nature Publishing Group в партнерстве с Институтом системной биологии.«В прошлом большинство перепрофилированных лекарств были обнаружены случайно.

Например, препарат амантадин был впервые введен для лечения респираторных инфекций. Однако несколько лет спустя у пациентки с болезнью Паркинсона во время приема препарата наблюдалось резкое улучшение симптомов болезни. для лечения гриппа.

Это наблюдение вызвало дополнительные исследования. Теперь амантадин одобрен Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов и как противовирусный, и как противопаркинсонический препарат.

Но мы не можем полагаться только на шанс найти лекарство от орфанной болезни », — сказал он. Доктор Михал Брылински, руководитель группы вычислительной системной биологии ЛГУ.Чтобы систематизировать перепрофилирование лекарств, Надери, соавтор Раджив Ганди Говиндарадж и его коллеги объединили eMatchSite, программное обеспечение, разработанное той же группой, с виртуальным скринингом, чтобы найти одобренные FDA лекарства и белки, которые участвуют в лечении редких заболеваний. Суперкомпьютеры LSU позволяют им тестировать миллионы возможностей, проверка которых в лаборатории будет стоить миллиарды долларов.

Эта работа была поддержана Национальным институтом общих медицинских наук Национальных институтов здравоохранения [R35GM119524].