Чтобы лучше понять, как развивается рак, ученые стремятся определить генетические факторы — наследственные или приобретенные, — которые могут служить катализатором или спусковым крючком для прогрессирования опухоли. До сих пор генетическая основа рака изучалась только в кодирующих областях генома, которые составляют только 2% от него.
Однако, как показали недавние научные достижения, остальные 98% далеко не неактивны: они включают элементы, которые служат для регулирования экспрессии генов и, следовательно, должны играть важную роль в развитии рака.
Чтобы лучше понять эту роль, профессор Луи-Жанте Эммануил Дермитзакис и его команда из отдела генетической медицины и медицины развития медицинского факультета UNIGE изучали колоректальный рак, один из самых распространенных и самых смертоносных видов рака. Действительно, каждый год во всем мире выявляется один миллион новых случаев, и почти для половины этих пациентов болезнь оказывается фатальной.
Используя технологию секвенирования генома, генетики UNIGE сравнили РНК между здоровой тканью и опухолевой тканью 103 пациентов, ища регуляторные элементы, присутствующие в обширной некодирующей части генома, которые влияют на развитие колоректального рака. Цель состояла в том, чтобы идентифицировать эффект приобретенных мутаций, активация которых могла бы вызвать заболевание, присутствующее только в раковой ткани. Этот подход совершенно новый: это первое исследование этой шкалы, в котором изучается некодирующий геном онкологических больных.
Неизвестные мутации
Команда UNIGE смогла идентифицировать два вида некодирующих мутаций, которые влияют на развитие колоректального рака. Они обнаружили, с одной стороны, наследственные регуляторные варианты, которые не активны в здоровых тканях, но активируются в опухолях и, по-видимому, способствуют прогрессированию рака. Это показывает, что наследуемый нами геном не только влияет на нашу предрасположенность к развитию рака, но также влияет на его прогрессирование.
С другой стороны, исследователи определили влияние приобретенных мутаций на регуляцию экспрессии генов, которые влияют на генез и прогрессирование колоректальных опухолей.
«Элементы, ответственные за развитие и прогрессирование рака, расположенные в некодирующем геноме, столь же важны, как и те, которые находятся в кодирующих областях генома.
Таким образом, анализ генетических факторов во всем нашем геноме, а не только в кодирующих областях, как это делалось раньше, дает нам гораздо более полное представление о генетике колоректального рака », — объясняет Халит Онген, ведущий автор этого исследования. «Мы применили эту совершенно инновационную методологию к колоректальному раку, но ее можно применить для понимания генетической основы всех видов рака», — подчеркивает профессор Дермитзакис.