Системы для определения целей лечения рака и редких заболеваний

Теперь ученые из Сингапурского института генома (GIS) A * STAR сообщили об очередном прорыве в разработке экспертных систем, которые могут обрабатывать большие наборы данных, объединяя сложную информацию о заболеваниях, чтобы помочь врачам в диагностике и лечении заболеваний. Последней в этой серии является разработка системы под названием OncoIMPACT, которая объединяет данные о онкологических заболеваниях и модели, полученные от сотен пациентов, чтобы лучше отсеивать генетические мутации и выбирать потенциально причинные.

Ведущий исследователь в этом исследовании, доктор Ниранджан Нагараджан, заместитель директора по вычислительной и системной биологии ГИС, отметил: «Мы особенно рады способности OncoIMPACT учитывать уникальный генетический состав каждого пациента для прогнозирования целей лечения. Это позволяет нам обрабатывать массивные наборы данных генома рака интегративным и модельным образом, чтобы свести их к нескольким ключевым мутациям драйверов."
Доцент Йоханнес Шумахер из Института генетики человека при Боннском университете добавил: «Интеграция различных наборов данных« omics »для идентификации генов-драйверов рака является сложной задачей. OncoIMPACT заполняет пробелы в интегративном анализе и дает возможность пересмотреть большие комплексные наборы данных для идентификации генов, вызывающих заболевания."

Команда исследователей из A * STAR применила OncoIMPACT к более чем тысячам раковых заболеваний, таких как меланомы, глиобластомы, рак простаты, мочевого пузыря и яичников, и в настоящее время составляет полную карту мутаций-драйверов для разных видов рака. В этом исследовании они также продемонстрировали доказательство концепции использования сигнатур мутаций драйвера для прогнозирования клинических результатов для онкологических больных. Это захватывающая альтернатива доступным в настоящее время тестам, основанным на уровнях РНК и белка, поскольку ДНК можно анализировать более надежно, и команда планирует продолжить эту работу.
Д-р Нагараджан отметил: «Мы надеемся создать ресурс для исследователей рака и клиницистов в Сингапуре и во всем мире.

Мы предвидим будущее, в котором экспертные системы, такие как OncoIMPACT, смогут использовать геномные данные, полученные во всем мире, и внести свой вклад в персонализированную и целевую медицину в Сингапуре."
Доктор Гопал Айер, главный исследователь лаборатории терапевтических исследований рака Национального онкологического центра Сингапура (NCCS), отметил: «При наличии большого количества генетических данных трудно сосредоточить наше внимание на реальной причине и движущих силах рака.

Существует ряд алгоритмов, которые помогают сузить поиск по группам раковых заболеваний. Однако OncoIMPACT отличается тем, что может сфокусировать эти анализы на одном пациенте. Это первый шаг к истинной индивидуализации лечения: если мы сможем раскрыть движущие силы опухоли у конкретного пациента, мы можем спросить, можно ли потом лечить это конкретными лекарствами."
OncoIMPACT является последней из серии экспертных систем ГИС и следует за недавней публикацией Phen-Gen — первой такой системы, которая перекрестно связывает симптомы пациента с последовательностью генома для выявления причинных генов для редких заболеваний.

Оба метода относятся к развивающейся области интегративной омики, где сложные многомерные наборы данных совместно анализируются с помощью сложных алгоритмов для выявления новых биологических и медицинских открытий.

Портал обо всем