Протеомика — это крупномасштабный анализ всех белков в типе клетки, типе ткани или организме. В отличие от геномики, которая показывает, как генетические различия могут указывать на потенциал человека для развития болезни в течение всей жизни, протеомика делает снимок белкового профиля пациента во время болезни в реальном времени.
Врачи могут использовать эту информацию для постановки диагноза и начала лечения, иногда задолго до того, как традиционный диагноз даже начинает определять причину.
«Протеомика позволяет нам создать точный молекулярный диагноз, полностью персонализированный для пациента», — говорит Винит Махаджан, M.D., Ph.D., Клинический доцент кафедры офтальмологии и визуальных наук UI, лауреат премии RPB за развитие карьеры 2011 года.
Лаборатория Махаджана недавно использовала протеомику для разработки успешной стратегии лечения пациента с увеитом, потенциально слепящим заболеванием глаз, которое может иметь множество причин, что особенно затрудняет диагностику и эффективное лечение. Выводы команды описаны в статье, опубликованной в феврале. 11 номер журнала JAMA Ophthalmology.
Пациент терял зрение на один глаз из-за рецидива воспаления и отека сетчатки с образованием рубцовой ткани. Причина была неизвестна, поэтому лечение проводилось методом проб и ошибок, основанным на клиническом наблюдении за симптомами.
«В настоящее время не существует точного лекарства от этого вида болезней», — говорит Махаджан.
Затем Махаджан и его команда выполнили протеомный анализ жидкости, взятой из глаза пациента, и сравнили этот белковый профиль с профилями глазной жидкости других пациентов. Габриэль Велес, аспирант лаборатории Махаджана, обнаружил паттерн, который очень напоминал паттерн двух других пациентов, у которых было известно, что у них аутоиммунное заболевание, вырабатывающее антитела против сетчатки.
«Ее симптомы не совсем соответствовали стандартному клиническому диагнозу этой болезни», — говорит Натаниэль Ройбал, M.D., Ph.D., научный сотрудник витреоретинальной хирургии, работающий с Махаджаном. "Ей не хватало многих функций. Но основываясь на этой модели, которую мы видели, мы заказали лабораторный тест, чтобы проверить, вырабатывает ли она антитела против сетчатки.
И, конечно же, тест показал, что она. Итак, мы изменили то, как мы относились к ней."
Махаджан провел операцию и имплантировал устройство, которое выделяет стероид в глаз.
У пациентки улучшилось зрение, у нее больше нет рецидивов.
Александр Г. Басюк, М.D., Ph.D., Доцент педиатрии UI, соавтор статьи, говорит, что ценность личной протеомики выходит за рамки увеита.
«Мы используем эту платформу для решения других видов глазных и воспалительных заболеваний, когда лучший диагноз и методы лечения для отдельных пациентов остаются неадекватными», — говорит Басюк.
В то время как протеомика изучается в других местах, в первую очередь для диагностики, Махаджан говорит, что реализация пользовательского интерфейса уникальна, потому что в ней используется подход «всего пациента», который координирует сбор, транспортировку, хранение, кодирование и анализ образцов таким образом, чтобы можно было напрямую и эффективно улучшать уход за пациентами.
«Мы смогли объединить хирургию и науку и разумно вернуться к пациенту, чтобы выбрать оптимальную терапию», — говорит Махаджан. "Это персонализированная точная медицина. Это следующий шаг."
Исследование частично финансировалось за счет грантов Национального института здоровья, Благотворительного фонда Дорис Дьюк и Фонда исследования по предотвращению слепоты.