Тест был разработан для удовлетворения потребностей программы лечения ретинобластомы в Центре зрения CHLA, одной из крупнейших клинических программ в США.S., лечение примерно 20% случаев ретинобластомы в стране и прием до 50 новых пациентов каждый год.
Ретинобластома — злокачественный рак раннего детства, который возникает из незрелых клеток сетчатки в одном или обоих глазах — может начать расти в любое время до рождения примерно до семи лет. Среди младенцев и детей общие признаки этого рака включают наличие белого «свечения» или «блеска» в зрачке одного или обоих глаз, наличие белого зрачка на цветной фотографии или скрещенных или смещенных глаз.
Раннее выявление жизненно важно, потому что, если ее не лечить, ретинобластома может привести к слепоте или смерти.
В случаях зародышевой линии мутация, вызывающая заболевание, присутствует в клетках по всему телу, что приводит к опухолям обоих глаз, а также в других частях тела. Поэтому раннее выявление и точная диагностика имеют решающее значение для определения наилучшего курса лечения.
Команда врачей и ученых из Центра персонализированной медицины Департамента патологии и лабораторной медицины, работая с клиницистами и хирургами из Центра зрения, разработала панель секвенирования ретинобластомы следующего поколения (RB1 NextGen) CHLA на основе технологии глубокого секвенирования ДНК с использованием новейших технологий. техническая и биоинформатическая методология секвенирования всего гена RB1.
Обычное генетическое тестирование ретинобластомы обычно включает секвенирование определенных горячих точек в гене, где, как известно, существуют многочисленные мутации.
Когда исследователи CHLA намеревались разработать свой собственный лабораторный тест, они использовали совершенно другой подход, чтобы секвенировать весь ген от конца до конца.
«Как правило, мы использовали возможность секвенирования NextGen для секвенирования многих генов с относительно небольшой глубиной охвата», — пояснил Александр Джудкинс, доктор медицинских наук, FRCP, глава отделения патологии и лабораторной медицины. «Наша команда использовала совершенно другой подход, решив взглянуть на большую глубину охвата одного гена, секвенировав весь ген, что технически очень сложно сделать.»
При существующем подходе NextGen к секвенированию ретинобластомы есть участки генов, которые вообще не исследуются, что потенциально позволяет упустить важные данные, добавил Тимоти Триче, доктор медицинских наук, директор Центра персонализированной медицины при CHLA. «Новые данные говорят нам, что некодирующая ДНК чрезвычайно важна. И одна из сильных сторон нашего подхода — изучить те области, которые не связаны с кодированием.»
Посредством секвенирования всего гена исследователи могут увидеть более частые случаи мутаций зародышевой линии гена RB.
Поскольку мутации зародышевой линии могут передаваться, эти знания могут лучше информировать пациентов о правильном подходе к лечению при выявлении этих мутаций.
«Раньше мы думали, что если у ребенка опухоль в одном глазу, а не в другом, это результат соматической мутации. А поскольку соматические носители не передают мутировавшие гены, мы полагали, что удаление опухоли остановило рак », — говорит Том Ли, доктор медицины, директор Центра зрения при CHLA. «Но теперь мы знаем, что есть процент — порядка 10–15% тех детей, у которых была очевидная соматическая мутация — которые на самом деле несут мутацию зародышевой линии, что подвергает их риску развития последующих опухолей в подростковом возрасте или ранняя зрелость.»
Ли сказал, что способность определять наличие мутаций зародышевой линии RB1 на ранней стадии имеет важные последствия — не только для прогноза нового пациента с ретинобластомой, но и для братьев и сестер, которые также могут подвергаться риску, и, в конечном итоге, для собственных детей пациента, если У выжившего после ретинобластомы обнаружена мутация зародышевой линии, которая может быть передана будущим поколениям.
Благодаря лечению сотен детей с ретинобластомой, CHLA теперь может предложить этот уникальный и комплексный скрининговый тест выжившим после болезни или членам их семей, а также пациентам в других онкологических центрах. «Мы считаем, что братьев и сестер и детей носителей зародышевой линии следует проверять сразу после рождения, потому что раннее обнаружение генных мутаций может спасти зрение пациента», — говорит Ли.
Примерно две трети пациентов с ретинобластомой в CHLA имеют односторонние случаи РБ или рака только одного глаза.
Хотя только 15% случаев дают положительный результат на мутацию зародышевой линии, врачи должны лечить всех пациентов так, как если бы рак потенциально мог быть двухсторонним или присутствовать в обоих глазах, состояние, обычно связанное с мутацией зародышевой линии. «Исторически генетическое тестирование может занимать до трех или четырех месяцев, а это очень долгий срок, если на карту поставлено здоровье ребенка», — сказал Джонатан Ким, доктор медицины, директор программы по ретинобластоме в CHLA. «Проведение тестов быстрее и на месте может значительно улучшить результаты лечения для всех наших пациентов.»
«Этот тест позволяет нашим исследователям более всесторонне изучить ген RB1», — говорит Джадкинс. Мы надеемся, что сбор новых геномных данных по RB1 позволит базовым исследователям преобразовать этот материал в биологически значимые идеи, что приведет к более раннему выявлению и новым методам лечения как первичного, так и рецидивирующего заболевания.»
Немного на этих днях про сигареты оптом в спб много интересного почитал, на мой взгляд это интересно и очень важно. Очень полезная информация.