Автором исследования, опубликованного 24 августа в журнале Nature Genetics, является Майкл Гатца, доктор философии, ведущий автор и научный сотрудник после докторантуры; Грейс Сильва, аспирант; Джоэл Паркер, доктор философии, директор по биоинформатике, UNC Lineberger; Ченг Фань, научный сотрудник; и старший автор Чак Перу, доктор философии, профессор генетики и патологии.Эти исследователи изучили множество путей, вызывающих рак, которые представляют собой поэтапные генетические изменения, при которых нормальные клетки переходят в раковые, включая путь, который регулирует скорость роста раковых клеток.
Считается, что высокая скорость роста клеток, также известная как пролиферация клеток, связана с плохим прогнозом для пациентов с раком груди.Анализируя несколько типов геномных данных, исследователи UNC Lineberger смогли идентифицировать восемь генов, которые были амплифицированы на уровне геномной ДНК и необходимы для пролиферации клеток при раке молочной железы в просвете, который является наиболее распространенным подтипом рака молочной железы.
«Используя этот новый вычислительный подход, мы смогли воспользоваться преимуществами обширных ресурсов данных, которые существуют, и определить ряд новых потенциальных мишеней для лекарств для конкретной подгруппы пациентов с раком груди. Это важный шаг на пути к более персонализированной медицине. "сказал Перу.Фактически, один из идентифицированных генов — CPT1A — уже является мишенью для разработки лекарств от лимфомы и потенциально может быть протестирован на пациентах с раком груди.
Было показано, что лекарственные средства, нацеленные на CPT1A, ингибируют рост линии раковых клеток человека in vitro и на мышиных моделях лимфомы.Этот аналитический подход, используемый для лучшего понимания движущих сил рака, включает всесторонний и интегрированный анализ нескольких типов данных, включая данные об экспрессии генов, соматические мутации, количество копий ДНК и набор данных функциональной геномики.
Хотя исследование было сосредоточено на выявлении генетических драйверов рака груди, этот подход можно легко применить и к другим типам опухолей. Ведущий автор Майк Гатца добавил: «Хотя нам удалось точно определить факторы, вызывающие рак груди, этот подход может и будет применяться к другим типам опухолей в будущем».