Чтобы понять распространение морской флоры и фауны, доктор Накамура изучает бентос — животных, сидячих или почти не двигающихся во взрослом возрасте. В их число входят глубоководные водоросли, кораллы, строящие рифы, и морские звезды, являющиеся коралловыми хищниками — терновым венцом.
Осенью 2011 года она поднялась на борт глубоководного исследовательского судна Японского агентства морской науки и технологий (JAMSTEC) для сбора образцов глубоководного бентоса из гидротермальных жерл в Окинавском желобе. Гидротермальные источники, где нагретая, насыщенная минералами морская вода извергается из трещин в океанской коре, являются домом для различных организмов. Из собранных образцов Накамура отвезла несколько глубоководных морских рыбок в свою лабораторию, чтобы изучить их формирование популяции и модели колонизации. Она сделала это, изучив две характеристики: длину скорлупы и характер распределения.
Каждый образец был тщательно измерен, чтобы определить время, в течение которого образец прожил в колонии. Чем больше длина раковины, тем дольше обитает.
Чтобы понять закономерности распределения, Накамура изучает процесс оплодотворения блюдец. Посредством микроскопических наблюдений срезов тканей гонад лимба она подтвердила стадии развития яйцеклетки и сперматозоидов. В то время как у блюдец есть различный мужской и женский пол, у самок есть похожий на мешок орган, называемый сперматекой, для хранения спермы для внутреннего оплодотворения. Накамура также обнаружил, что яйцеклетки и сперматозоиды на разных стадиях зрелости одновременно сосуществуют в генитальных железах блюдца.
Блюдки подвергаются непрерывному процессу оплодотворения, при котором каждая яйцеклетка появляется, когда достигает зрелости. Это отличается от оплодотворения кораллов, при котором одновременно выделяются многочисленные зрелые яйцеклетки и сперматозоиды, которые оплодотворяются в воде.
Оплодотворенные яйца блюдец, выпущенные в море, дрейфуют через личиночную стадию роста, в конечном итоге находя дом и прикрепляясь к морскому дну, чтобы присоединиться к сообществу бентоса. Группа морской биофизики OIST, в которую входит доктор Накамура, также изучает океанические течения, которые оказывают значительное влияние на распространение бентосных личинок. Команда пытается понять особенности жизненного цикла бентоса на начальном этапе и влияние океанских течений, чтобы выяснить, как эти организмы расширяют свою среду обитания и реагируют на изменения окружающей среды.
Доктор Накамура выходит на воду и из первых рук наблюдает за морскими организмами. Этот подход основан на ее убеждении, что некоторые вещи можно понять только путем наблюдения за их естественным состоянием и что информацию, полученную в результате этих наблюдений, следует ценить. «Я хотел бы передать следующему поколению исследователей тщательный подход к полевым исследованиям для понимания экосистем», — сказал доктор Накамура.
Накапливая понимание экологии мелких морских организмов, она надеется углубить понимание распространения жизни во всем океане.